「生態工程技術研發中心」成立的主要目的乃整合本校在生態工程相關的研究成果及研究資源(包括研究人員及專任教師、儀器設備、研究計畫及產學合作關係)，並規劃出有系統的生態工程研究主題，提供未來本校發展生態工程的研究方向；並妥善運用研發成果進行營運管理，透過產學合作計畫及技術轉移，爭取經費資源增加研發中心的研發能量；並期望本研發中心的成功運作能帶動本校其他研究團隊的整合，使本校能成為一所技術研發領導教學的永續性科技大學。